- 连同文件一起保存（⌘S）：保存
.pmix，并把用到的素材复制到工程文件夹中的pmix_media，以相对路径记录。原文件不会被移动或删除；名称相同但内容不同的文件会自动命名为「名称 (2)」。复制在后台进行，耗时较长时会显示进度，可选「后台运行」或「取消」（取消时先保存工程文件，下次保存时继续复制）。 - 仅保存项目：只保存
.pmix，不复制素材。工程文件夹外的素材以绝对路径记录。 - 另存为…（⇧⌘S）：保存到新的位置，并复制素材。
- 自动保存：在新建工程或设置中开启。只对已经保存过的工程有效，会直接覆盖原
.pmix（不另建备份）。
迁移到其他 Mac
先用「连同文件一起保存」，再把整个工程文件夹（.pmix 和 pmix_media）一起复制。旧版本工程的素材可能在 _media 文件夹中，软件会自动查找。
素材找不到时
- 「文件」→「重新链接缺失的媒体…」：选择文件夹，按文件名（含子文件夹）查找并重新链接，结果显示在状态栏。
- 「在访达中显示媒体文件夹」「设置媒体文件夹…」也在「文件」菜单中。
缩略图和波形的缓存保存在 pmix_media/.preview_cache，复制工程文件夹时会一并保留。